یکی از روش‌های متداول در تحقیقات دریایی، مدل‌سازی جریان با استفاده از روش دینامیک سیالات محاسباتی (CFD) است. این روش می‌تواند به صورت مؤثر و مفید برای محاسبه مقاومت کشتی، مدل‌سازی حرکات دینامیکی آن در جهات مختلف و بررسی تأثیر امواج و …استفاده شده و امکان آزمایش در یک محیط مجازی، بدون صرف هزینه‌های مربوط به تست‌های واقعی را فراهم سازد. در بخش شبیه‌سازی، کد عددی مستقلی توسط کارشناسان مرکز با قابلیت‌های زیر توسعه یافته است:
- جریان لزج غیر قابل تراکم
- شبیه‌سازی جریان سطح آزاد با تغییر شکل‌های پیچیده در فصل مشترک
- شبیه‌سازی امواج و اندرکنش‌های ۶ درجه آزادی سازه و سیال
- استفاده از شبکه بی‌سازمان و شبیه‌سازی هندسه‌های پیچیده
